JR九州は、豪雨の影響により、各路線で運転を見合わせる。
肥薩線の八代～吉松駅間は終日運転を見合わせる。日豊本線の西都城～国分駅間、日南線の南郷～志布志駅間、肥薩線の吉松～隼人駅間、吉都線の都城～吉松駅間、指宿枕崎線の五位野～枕崎駅間は、正午ごろまで運転の見合わせを決めた。
九州新幹線の熊本～鹿児島中央駅間、日豊本線の南宮崎～西都城駅間と国分～鹿児島中央駅間、日南線の南宮崎～南郷駅間、指宿枕崎線の鹿児島中央～五位野駅間は、始発から本数を減らして運転している。
かわせみ やませみ号、SL人吉号、いさぶろう･しんぺい号、はやとの風1号・2号、指宿のたまて箱1号・2号は運休する。特急きりしま号は始発から運転見合わせている。特急海幸山幸号は通常運転する。
